This post is also available in: English (English)

Công nghệ Phenotype MicroArrays là gì?

Phenotype MicroArrays của Biolog là một công nghệ cung cấp cái nhìn sâu sắc về quá trình trao đổi chất của các tế bào vi sinh vật trong hệ thống đĩa 96 giếng.

Phenotype MicroArrays (PM) đại diện cho công nghệ chính thứ ba, bên cạnh công nghệ DNA Microarrays và Proteomic, cần thiết trong kỷ nguyên gen về nghiên cứu và phát triển thuốc. Giống như DNA Microarrays và Proteomic Technologies có thể phân tích đồng thời hàng nghìn gen hoặc protein,  Phenotype MicroArrays còn giúp đo lường định lượng hàng nghìn kiểu hình tế bào cùng một lúc.

Ưu điểm của công nghệ Phenotype MicroArrays

Công nghệ Phenotype MicroArrays cho phép các nhà nghiên cứu đánh giá gần 2000 kiểu hình của một tế bào vi sinh vật trong cùng một thí nghiệm. Thông qua việc định lượng toàn diện và chính xác các kiểu hình, các nhà nghiên cứu có thể có được góc nhìn khách quan về tác động lên các tế bào sự khác biệt di truyền, thay đổi môi trường và tiếp xúc với thuốc và hóa chất. Công nghệ này giúp người dùng có thể:

• Liên kết kiểu gen với kiểu hình
• Xác định đặc tính nhạy cảm hóa học và trao đổi chất của tế bào
• Khám phá các mục tiêu mới cho các hợp chất kháng khuẩn
• Tối ưu hóa các dòng tế bào và điều kiện nuôi cấy trong phát triển quy trình sinh học
• Đặc trưng kiểu hình tế bào cho các nghiên cứu phân loại hoặc dịch tễ học

Cấu tạo của Phenotype MicroArrays

Phenotype MicroArrays sử dụng các microplate 96 giếng được thiết kế sẵn chứa các loại hợp chất hóa học khác nhau được thiết kế để kiểm tra sự hiện diện hay vắng mặt của các kiểu hình tế bào cụ thể. Mỗi giếng trong microplate được thiết kế để kiểm tra một kiểu hình khác nhau sau khi cấy huyền phù tế bào đã chuẩn hóa, cho phép kiểm tra đồng thời hàng nghìn kiểu hình trong một thí nghiệm. Có 10 panel được thiết kế để thẩm tra các con đường trao đổi chất cùng với các hiệu ứng ion, thẩm thấu, pH, và 10 panel để đánh giá độ nhạy cảm với các loại thuốc kháng sinh khác nhau với các cơ chế hoạt động khác nhau.

Sơ đồ các panel Phenotype MicroArrays:

• PM1 – PM10: Thử nghiệm trao đổi chất cho vi khuẩn và nấm
• PM11 – PM20: Thử nghiệm độ nhạy hóa học đối với vi khuẩn
• PM21 – PM25: Thử nghiệm độ nhạy hóa học đối với nấm

Công nghệ Phenotype MicroArrays hoạt động như thế nào?

DNA Microarrays và Proteomic Technologies cho phép các nhà khoa học phát hiện các gen hoặc protein được điều hòa lõi và các kiểu thay đổi của chúng tương quan với một số thứ quan trọng như trạng thái bệnh. Tuy nhiên, không có gì đảm bảo rằng những thay đổi này thực sự có ý nghĩa đối với tế bào. Phenotype MicroArrays là một công nghệ bổ sung cung cấp thông tin cần thiết ở cấp độ tế bào.

Phenotype MicroArrays sử dụng công nghệ oxi hóa khử được cấp bằng sáng chế của Biolog, với quá trình hô hấp tế bào (sản sinh NADH). Nếu kiểu hình “dương tính” mạnh trong giếng, tế bào hô hấp tích cực, dẫn đến khử thuốc nhuộm tetrazolium và tạo thành màu đậm. Nếu nó dương tính yếu hoặc âm tính quá trình hô hấp diễn ra chậm hoặc ngừng lại, và kết quả là ít màu hoặc không màu.

Xét nghiệm oxi hóa khử cung cấp cả khả năng khuếch đại và định lượng chính xác các kiểu hình. Quá trình ủ và ghi dữ liệu kiểu hình được thực hiện tự động bởi thiết bị định danh vi sinh vật OmniLog.

Để so sánh các kiểu hình của hai dòng tế bào, một dòng được ghi lại dưới dạng dấu vết màu đỏ (tham chiếu) và một dòng là dấu vết màu xanh lá cây (thí nghiệm thực tế). Những biểu đồ này sau đó có thể được phần mềm tin sinh học phủ lên để phát hiện sự khác biệt. Các vùng chồng lấp có màu vàng, trong khi các điểm khác biệt được đánh dấu bằng các mảng màu đỏ hoặc xanh lục.

Thu thập và phân tích dữ liệu công nghệ Phenotype MicroArrays bằng phần mềm định danh vi sinh vật OmniLog

Phần mềm định danh vi sinh vật OmniLog PM chứa một bộ thuật toán hoạt động cùng với hệ thống OmniLog PM và panel Phenotype MicroArrays để tự động ủ tối đa năm mươi microplate ở nhiệt độ cố định do người dùng kiểm soát với bộ dữ liệu đầy đủ xét nghiệm so màu theo thời gian. Các chương trình này cho phép hiển thị dữ liệu động học từ các panel PM được hệ thống OmniLog PM ghi lại, quản lý và phân tích dữ liệu, xuất dữ liệu ở dạng thô và đã xử lý, đồng thời tạo báo cáo.

Chức năng của phần mềm OmniLog:

• Trích xuất danh sách dữ liệu từ phần mềm Quản lý tệp/Phân tích động học
• Tính toán các tham số từ dữ liệu động học
• Cho phép so sánh hai danh sách dữ liệu
• Làm nổi bật các giếng và tạo báo cáo về các kiểu hình PM khác biệt
• Cho phép xác định chất nền trong tất cả các bảng PM
• Liên kết các chất nền trong tấm PM với cơ sở dữ liệu KEGG

Để biết thêm chi tiết về hệ thống định danh vi sinh vật OmniLog, xem thêm tại: https://htigroup.vn/he-thong-dinh-danh-vi-sinh-vat-tu-dong/

Hoặc liên hệ cho chúng tôi để biết thêm thông tin chi tiết về sản phẩm hotline: 098.123.0055